Nederlands Subsidie Instituut heeft klanten in onder meer de volgende sectoren:
- Voedingsmiddelen
- Milieutechnologie
- Energietechnologie
- Energieopwekking
- Bouw en vastgoedontwikkeling
- Informatietechnologie
- Automotive
- Creatieve sector
- Verpakkingsmiddelen
- Zakelijke diensten
- Infrastructuur
- Telecom